DNA数据库EMBL
EMBL是DNA数据库中欧洲分子生物学实验室的缩写。解释如下:欧洲分子生物学实验室 EMBL是DNA数据库中一个重要的组成部分,它位于欧洲,致力于分子生物学领域的研究。DNA数据库是存储生物遗传信息的巨大数据库,其中包含了大量的DNA序列数据。
欧洲生物信息学研究所(EBI)的DNA数据库,EMBL,是一个全球性的核酸序列资料宝库。其数据来源多元化,既接收科研人员和基因组测序机构直接提交的序列,也从科技文献和专利中获取信息(Stoesser等, 1998)。
欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)所建立的DNA序列数据库,被称为EMBL。这个数据库的信息主要来源于两个渠道:一是科研人员或基因组测序机构通过网络直接提交;二是科技文献和专利中的数据(Stoesser等人,1998年)。
EMBL-DNA数据库成立于1982年,与GenBank和DDBJ共同构成全球性的国际DNA数据库。EBI,EMBL在英国Hinxton的分支,主要负责建立和维护EMBL-DNA数据库,支持核苷酸序列检索与序列相似性查询。EMBL的研究涵盖了多个领域,包括质谱分析、细胞生物学、细胞生物物理、分化、基因表达、结构生物学等。
DNA数据库的规模正在以指数方式增长,平均不到9个月就增加一倍。
GenBank:由美国国家生物技术信息中心(NCBI)管理,自1982年起运营,是全球最大的公共核苷酸序列数据库之一,收纳了数百万条来自世界各地的DNA和RNA序列,涵盖众多生物体的基因组、转录组和蛋白质组数据。
国际上三个大的生物信息中心有哪些
1、美国国家生物技术信息中心(NCBI)NCBI是一个用户友好的网站,其主页清晰地阐述了中心的工作内容以及最新的研究领域热点。为了帮助用户更好地掌握和使用网站资源,NCBI在主页上提供了明确的站点导航,对初学者来说非常友好。
2、DDBJ(DNA Data Bank of Japan):DDBJ是日本的国家生物信息学中心,成立于1986年。DDBJ的主要职责是收集、存储、分析和发布日本的生物数据,包括DNA序列、蛋白质序列、基因组数据等。DDBJ的数据库不仅包含了日本本土的数据,还包含了来自全球各地的数据,其中包括许多重要的科研成果。
3、美国国立生物技术信息中心:美国国立生物技术信息中心,位于马里兰州的贝塞斯达,参议员Claude Pepper意识到信息计算机化过程方法对指导生物医学研究的重要性,发起了在1988年11月4日建立国立生物技术信息中心的立法。
4、后来的参议员Claude Pepper意识到信息计算机化过程方法对指导生物医学研究的重要性,发起了在1988年11月4日建立国立生物技术信息中心(NCBI)的立法。NCBI是在NIH的国立医学图书馆(NLM)的一个分支。
这几个蛋白质数据库,你想要的几乎都有!
数据:The Human Protein Atlas(人类蛋白质图谱数据库),基于蛋白组学、转录组学以及系统生物学数据,可以绘制蛋白质图谱的数据库。免费提供人类编码蛋白信息的公共数据库,包含24,000种编码人类蛋白质的基因在44个正常组织、18种肿瘤组织、69个细胞系和18种血液细胞的mRNA和蛋白质表达信息。
蛋白质数据库有以下多个: PDB蛋白质数据库 PDB(Protein Data Bank)是全世界最大的蛋白质结构数据库。它包含了大量的蛋白质三维结构信息,这些结构信息是基于X射线晶体学和核磁共振等实验手段得到的。科研人员可以通过该数据库查询蛋白质的结构、功能以及其他相关信息。
蛋白质互作、蛋白质网络数据库 3DID(3D interacting domains)网址: http://3did.irbbarcelona.org gatealoy.pcb.ub.es/3did...简介:提供已知3D结构的蛋白质互作信息。DOMINE 网址: http://domine.utdallas.edu 简介:提供结构域互作数据。
UniProt是目前最大的蛋白质数据库之一,它包含了来自不同生物物种的蛋白质序列、结构、功能等信息。UniProt数据库的数据来源包括实验室研究、文献报道、计算预测等多种途径,数据质量较高,被广泛应用于生物信息学、生物学、医学等领域的研究。
UniProt UniProt是全球有关蛋白质方面信息最全面、使用频率高、冗余度最低的蛋白数据库,提供高质量的蛋白序列和功能信息。数据库由Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD三大数据库的数据整合而成。
EBI主要服务
作为欧洲的生物数据收集和传播中心,他们致力于维护和提供广泛的免费生物信息服务。EBI的核心数据库包括:ENA(核酸序列数据库),Ensembl(基因组数据库),ArrayExpress(基因表达数据),UniProtKB(蛋白质序列),InterPro(蛋白质家族/域/蛋白指纹),以及PDBe(大分子结构数据库)。
ebi是为科学界建立和维护生物学数据库,提供免费的数据和生物信息服务。支持生物学数据的存储和挖掘,促进了科技进步,通过生物信息学的基础研究继续推动生物学发展。为各个层次的科学工作者提供生物信息学培训,支持帮助边缘尖端科技成果向工业界的转化并协调欧洲生物数据的提供。
作为科学界的共享资源,EBI提供全面的免费生物信息服务,旨在推动基础科研的进步。研究所负责管理并维护一系列大型生物信息数据库,涵盖了基因组学、蛋白质组学、化学信息学、转录组学以及系统生物学等多个领域,为研究人员提供了丰富的数据平台和分析工具,便于他们分析和分享研究成果。
EBI的主要任务在于全面推动科学界的生物科学发展。首先,它致力于建立和维护一个开放的生物学数据库,这个平台提供免费的数据和生物信息服务,为科学研究者提供了存储和探索生物学数据的必要工具,从而加速了科技进步的步伐。
EBI是国际上知名的分子生物信息中心之一,位于英国的The Wellcome Trust Genome Campus。EBI的主要任务是确保分子生物学和基因组学的研究信息能够免费且公开地提供给科学界,以推动科学研究的发展。EBI提供的服务包括数据库的建立和维护、分子生物信息的相关服务、以及分子生物学和计算分子生物学的研究。
DNA数据库的EMBL
1、欧洲生物信息学研究所(EBI)的DNA数据库,EMBL,是一个全球性的核酸序列资料宝库。其数据来源多元化,既接收科研人员和基因组测序机构直接提交的序列,也从科技文献和专利中获取信息(Stoesser等, 1998)。
2、EMBL是DNA数据库中欧洲分子生物学实验室的缩写。解释如下:欧洲分子生物学实验室 EMBL是DNA数据库中一个重要的组成部分,它位于欧洲,致力于分子生物学领域的研究。DNA数据库是存储生物遗传信息的巨大数据库,其中包含了大量的DNA序列数据。
3、欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)所建立的DNA序列数据库,被称为EMBL。这个数据库的信息主要来源于两个渠道:一是科研人员或基因组测序机构通过网络直接提交;二是科技文献和专利中的数据(Stoesser等人,1998年)。
4、EMBL-DNA数据库成立于1982年,与GenBank和DDBJ共同构成全球性的国际DNA数据库。EBI,EMBL在英国Hinxton的分支,主要负责建立和维护EMBL-DNA数据库,支持核苷酸序列检索与序列相似性查询。EMBL的研究涵盖了多个领域,包括质谱分析、细胞生物学、细胞生物物理、分化、基因表达、结构生物学等。
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